3D-QSAR PORTAL Prof. RAGNO RINO

Descrizione

Portale di Chimica Farmaceutica Computazionale gratuito per uso non a scopo di lucro. Il portale permette:

  • Modellare molecole organiche in formato SMILES e la conversione in 2D e 3D [modulo Py-MolEdit]
  • Costruire modelli molecolari direttamente in 3D [modulo Py-MolEdit]
  • Fare analisi conformazionali con diversi motori di ricerca [modulo Py-ConfSearch]
  • Eseguire sovrapposizioni molecolari [modulo Py-Align]
  • Costruire modelli farmacoforici (solo per didattica) [modulo Py-Pharm]
  • Elaborare modelli di relazione struttura-attività quantitativi (QSAR) [modulo Py-QSAR]
  • Elaborare modelli di classificazione con algoritmi diintelligenza artificiale [modulo Py-Graph]
  • Fare modelli 3-D QSAR con la tecnica Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA) [modulo Py-CoMFA]
  • Prelevare dati strutturali dal Protein Data Base (PDB)  e studiare le interazioni ligando/macromolecole. [modulo Py-PDB]
  • Fare simulazioni di docking molecolare per studiare il binding mode di nuove molecole e validare il programma di docking. [modulo Py-Docking]
  • Generare modelli structure-based 3-D QSAR con la tecnica della "Comparative Binding Energy" (ComBinE)[modulo Py-COMBINE]
  • Studiare le molecole con i Campi di Interazione Molecolare (MIFs)

ERC scientific sector
LS1_13, PE6_13, PE4_13
Dipartimento o centro ospitante
Altro personale docente e di ricerca
  • Francesco Pirozzi

  • Alessandra Robello

  • Lidia Giuliano

Strumenti e attrezzature
Nome Descrizione Servizi Offerti Tipologia
3D QSAR web server Server per effettuare modelli di predizione Server
Ubicazione
Nome Stanza Edificio Piano
Sala macchine RCMD CU019 Piano interrato
Galleria
The 3D QSAR Portal

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