Cholangiocytes pathophysiology and Cholangicarcinoma

Anno
2020
Proponente Paolo Onori - Professore Ordinario
Sottosettore ERC del proponente del progetto
LS3_1
Componenti gruppo di ricerca
Componente Categoria
Antonio Picarelli Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Andrea Isidori Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Antonio Angeloni Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Arianna Casini Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Andrea Botticelli Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Antonello Mai Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Agnese Po Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Saula Checquolo Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Franco Locatelli Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Paolo Palange Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Vito D'Andrea Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Enrico Fiori Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Gianluca Mennini Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Maurizio Martelli Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Aurelia Rughetti Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Alessandro Laviano Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Laura Masuelli Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Massimo Rossi Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Cinzia Marchese Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Stefania Basili Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Luigi Cinque Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Rosa Vaccaro Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Laura Ottini Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Elisabetta Ferretti Co-proponenti / Other Principal Investigators
Domenico Alvaro Co-proponenti / Other Principal Investigators
Antonio Franchitto Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Enrico De Smaele Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Vincenzo Cardinale Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Quirino Lai Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Carola Severi Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Mariano Bizzarri Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Oliviero Riggio Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Marco Tafani Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Mara Cirone Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Felice Giangaspero Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Carlo Catalano Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Mary Anna Venneri Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Romina Mancinelli Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Cosimo Durante Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Alessio Molfino Componenti il gruppo di ricerca / Participants in the research project
Abstract

Cholangiopathies represent a heterogeneous group of human liver diseases comprising several conditions affecting the biliary tree. Cholangiocarcinoma (CCA) includes a heterogeneous group of cancers affecting the biliary tree. The primary target of these diseases is represented by cholangiocytes, the epithelial cells lining the bile ducts. Despite progress in the understanding of cholangiopathies and CCA, a considerable translational gap remains between putative targets and effective patient therapies. This is in part due to limited definition of the functional heterogeneity and interactome of cell lineages that contribute to these diseases.
The GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) and NCounter® Sprint Profiler is an integrated workstation developed by Nanostring® and represents a benchtop multiplex system that combines the advantages of high-throughput molecular (both proteomic and transcriptomic) analysis with the spatial definition of histological samples, allowing to perform molecular analysis from formalin-fixed, paraffin-embedded samples and to obtain data into a morphological context.
The general aim of this project is to unveil the complete identity, function, and molecular profile of cells involved in cholangiopathies and CCA. This could be pursued thanks to the use of full potentiality of the GeoMX DSP platform. Since cholangiopathies and CCA are characterized by cross-interaction among parenchymal cells (i.e. hepatocytes, cholangiocytes, stem/progenitor cells), myofibroblast population and inflammatory cells, the morphological distinction at single cell level will ensure a precise cell recognition and the identification of eventual modifications in the molecular profile induced by disease state. The multi-omics analyses will generate large datasets that could be processed by artificial intelligence approaches (e.g. machine learning and network medicine), that could lead to identify novel pathogenetic, diagnostic, and therapeutic targets.

ERC
LS3_1, LS3_12, LS4_6
Keywords:
EPATOLOGIA, MORFOLOGIA E IMAGING FUNZIONALE DELLE CELLULE, BIOLOGIA DELLE CELLULE STAMINALI, DIFFERENZIAMENTO, FISIOLOGIA E DINAMICA CELLULARE, IMMUNOSEGNALAZIONE

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